由SOX11基因新发无义变异引起的一例罕见Coffin-Siris综合征

Coffin-Siris综合征（Coffin-Siris syndrome，CSS）是一种常染色体显性遗传病，具有遗传异质性。该综合征的主要临床特征包括远端指骨或指甲发育不良、第五指发育异常、独特的面部特征（如面部粗糙）、多毛症、稀疏头皮发以及心脏等先天性畸形。SOX11基因位于染色体2p25.1上，编码一个转录因子，参与早期胚胎发育和神经系统的发育。

近年来，多项研究表明SOX11基因变异与多种发育缺陷有关。例如，Jia等人（2020）报道了SOX11基因突变的斑马鱼模型表现出类似CSS的多种发育缺陷。Pasquetti等人（2024）则发现SOX11基因的致病变异可能导致类似于Pitt-Hopkins综合征的表型。这些研究进一步证实了SOX11基因在发育过程中的重要作用。

此外，SOX11基因变异还与感觉神经性听力损失（Wang等人，2023）和耳蜗神经缺陷（Alburaiky等人，2022）有关。这些发现不仅扩展了对CSS的认识，也为相关疾病的诊断和治疗提供了新的线索。

国内研究团队介绍了一例罕见的CSS，该病例由SOX11基因的一个新发无义变异引起。研究通过全外显子组测序（WES）和第一代测序技术，对一名患有CSS的儿童进行了详细的临床表型和遗传变异位点分析，旨在加深对该综合征的理解，并协助其筛查和诊断。

研究采用高通量全外显子组测序（WES）和第一代测序技术，对患者的血液样本及其父母的血液样本进行检测，以确定疾病的遗传基础。患者的临床表型包括生长迟缓、身材矮小、脊柱裂、遗尿症和室间隔缺损。

WES结果显示，患者在SOX11基因位点存在一个新发变异（c.700G>T），该变异被分类为致病性变异。具体证据如下：

1.PVS1：该变异导致终止密码子的产生，影响蛋白质功能。

2.PM2：该变异未在中国基因组数据库、人类外显子数据库（ExAC）、参考人群1000基因组（100G）或人类基因突变频率数据库（gnomAD）中发现。

3.PM6：该变异是新发变异，未经过亲缘关系验证。

此外，家族验证结果表明，患者携带的SOX11基因c.700G>T变异是新发变异，其父母均未携带该变异。

总之，此次通过详细的临床表型分析和遗传检测，确认了一例由SOX11基因新发变异引起的CSS病例。这一发现不仅丰富了对人类基因变异的理解，也为早期诊断和遗传咨询提供了重要依据。未来的研究将进一步探讨SOX11基因变异的分子机制，为患者的治疗提供更多的可能性。

参考文献：

Guibin, Bai,Rougang, Yuan,Jian, Yuan et al. A rare Coffin-Siris syndrome induced by SOX11: a de novo nonsense variant of short stature.[J] .BMC Med Genomics, 2024, 17: 0.